Η κατάργηση των δασών είναι από τα μεγαλύτερα οικολογικά προβλήματα των τροπικών περιοχών. Για την καταπολέμηση του προβλήματος χρειάζεται να φυτεύονται με προτεραιότητα δένδρα που φυτρώνονται γρήγορα ως καφεόδενδρο, λεμονιά, πορτοκαλιά και άλλα.  
Μόλις πάψουν οι βροχές τα καφεόδενδρα ανθίζουν. Τα φύλλα τους που πέφτουν στο έδαφος περιέχουν πολλά χημικά συστατικά τα οποία εμπλουτίζουν το χώμα και αυξάνουν την παραγωγικότητά του.
Τα καφεόδενδρα έχουν την μεγαλύτερη ικανότητα σε σχέση με άλλα φυτά να εκταμιεύονται τα χρήσιμα συστατικά από το χώμα.

Επίσης σημαντικό είναι το γεγονός ότι στις φυτείες καφεόδενδρων φυτεύονται και άλλα δέντρα σαν πεύκους και κυπαρίσσους, τα οποία δημιουργούν σκιά για τα δέντρα του καφέ. Τα ψηλά δένδρα αυτά χρησιμοποιούνται επιπλέον από πολλά πουλιά που έχουν χάσει τις φωλιές τους λόγω της μαζικής κατάργησης των δασών.
Τις περιόδους άφθονων τροπικών βροχοπτώσεων τα φύλλα που πέφτουν από τα καφεόδενδρα δημιουργούν κάλυμμα στο χώμα, το οποίο προστατεύει το παραπάνω στρώμα του εδάφους.

Επίσης η καλλιέργεια καφέ κάθε χρόνο εξασφαλίζει δουλειά για εκατομμύρια ανθρώπους. Στις χώρες παραγωγούς του καφέ περίπου 20 εκατομμύρια οικογένειες καλύπτουν τις ανάγκες τους χάριν της δουλειάς στις φυτείες καφεόδενδρων.